2020年11月5日，农业农村部印发关于确定第一批国家农业绿色发展长期固定观测试验站的通知（农办规〔2020〕34号），经综合评价确定了16个观测试验站为第一批国家农业绿色发展长期固定观测试验站，植保所桂林试验站位列其中。

国家农业绿色发展长期固定观测桂林试验站位于广西兴安县，有“桂北粮仓”之称，是热带和亚热带交界地，作物种植种类多，病虫害种类繁多，发生危害严重，是研究水稻、热带和亚热带作物最理想的地区。由于兴安县地处“湘桂走廊”要冲，是我国水稻稻飞虱和稻纵卷叶螟等“两迁”害虫迁入长江中下游稻区的必经之地和主要危害区，是开展其监测和防控的咽喉要道，同时也是预防与控制东南亚地区外来农业有害生物传入的前沿阵地，和南方作物转基因安全评测的首选地区。试验站以华南山地丘陵区水稻病虫害监测与绿色防控模式为方向，开展水稻等南方作物病菌生理小种和害虫生物型变异、病虫害迁飞流行规律发生为害动态、病虫害抗药性和化学农药残留监测、转基因生物环境安全性评价、东南亚地区外来有害生物入侵风险评估和防控等研究，开展农业有害生物及其天敌长期固定观测工作。

自2007年4月起，中国农业科学院植物保护研究所在该地区利用毫米波扫描昆虫雷达系统开展稻飞虱、稻纵卷叶螟等重大迁飞性害虫的监测预警研究，并持续开展水稻病虫害综合治理与转基因作物安全评价研究工作。2009年基地挂牌为中国农业科学院桂林有害生物防治野外科学观测试验站，2011年被农业部命名为桂林作物有害生物防治野外科学观测试验站，2019年5月纳入国家农业科学观测实验站，命名为“国家植物保护桂林观测实验站”。